对生化系统微生物的生长造成影响的因素主要有温度、ph值、营养料及毒性物质等，调试运行中需要严格控制。
a、温度
一般活性污泥生存的适宜温度在15～35℃间。温度越高，活性污泥的繁殖速度越快，污染物的去除率越高。低于15℃或高于35℃时，活性污泥的去除率均会降低。温度低时可以采取增大反应池中活性污泥浓度方法，以保证去除效果。温度高时，应采取降温措施。
b、ph值
生物体的生化反应都在酶的参与下进行，酶反应需要合适的ph值范围，因此废水的ph值对生化处理系统影响很大。实践表明污水ph值保持在6～9之间较为适宜。特殊水质，活性污泥经驯化后对ph值的适应范围可得到提高。
c、营养物质
微生物新陈代谢过程中需要不同的元素物质，有些工业污水成分单一，含有的营养成分不一定满足或完全满足微生物的需要，这样会影响到污泥的活性和处理效果。此时就要靠外加营养物质来调配。微生物体内各种元素所占比例的通式为c5h7no2。碳可占菌体干重50%左右，生化处理的主要目的是去除含碳有机物，故不会缺碳。氮可占菌体干重的10%左右，氮源以氨态氮易为微生物利用。常投加氮类营养料如尿素、氨水等。微生物体内还含有少量p，p占菌体干重的1～2%。常投加磷盐营养料。
d、毒性物质
凡在废水中存在的对活性污泥中的细菌具有抑制或杀害作用的物质都称毒性物质。在调试运行处理中，我们应防止超过允许浓度的有毒物质进入。必要时应采用物理、化学方法进行预处理。
e、溶解氧
不同细菌对氧有不同的反应。细菌分为好氧性细菌、厌氧性细菌和兼氧性细菌。对于厌氧、好氧处理系统需要控制好溶解氧量。厌氧处理系统中溶解氧浓度一般应小于0.1mg/l；好氧处理系统中溶解氧浓度一般应大于0.3mg/l，控制在2~4mg/l范围内。
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